Fendas e cavidades de rochas graníticas e em bosques ripícolas.

Na Flora Iberica apenas é assinalada, aparentemente, uma única população em Portugal, na Serra do Soajo. Em 2016 descobriu-se uma nova subpopulação na Serra de Arga.

Scrophularia bourgaeana é um endemismo ibérico que em Portugal apenas se conhece atualmente na serra de Arga, onde apesar de ter sido alvo de prospeção dirigida, apenas se encontraram dois núcleos, ocorrendo numa linha de água com margens enrocadas. No passado haveria outra subpopulação na serra do Soajo, mas não é registada há cerca de 40 anos. É avaliada como Criticamente Em Perigo porque a população nacional é extremamente reduzida (menos de 40 indivíduos maduros), encontra-se em declínio continuado e está toda concentrada numa única subpopulação. Além disso apresenta um extensão de ocorrência e área de ocupação mínimas (apenas 4 km²), conhece-se uma única localização e infere-se o declínio continuado da qualidade do habitat. A aplicação de herbicida destruiu vários indivíduos recentemente, assinalando-se ainda outras pressões como ações de gestão de vegetação e a reconversão de lameiros para plantação de culturas agrícolas. Sugere-se a colheita de sementes para armazenamento em banco de germoplasma e para criação em viveiro ou jardim botânico que possa possibilitar futuras ações de repovoamento e o condicionamento de atividades que promovam a destruição de indivíduos. Deverá ser mantida a prospeção da planta e sugere-se a sua monitorização de modo a acompanhar a tendência populacional.

Coincya monensis puberula, Daboecia cantabrica, Hypericum pulchrum, Anemone trifolia, Hyacinthoides paivae, Tuberaria globulariifolia globulariifolia, Serratula tinctoria
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